Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms