Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms