Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms