Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5bQ80Y84 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm5bQ80Y84 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms