Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh8Q80Y20 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms