Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Ranbp1-201ENSMUST00000052325 923 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm21064-201ENSMUST00000189723 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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