Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NischQ80TM9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NischQ80TM9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NischQ80TM9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NischQ80TM9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
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