Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LnpkQ7TQ95 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms