Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD3

Robo2, Roundabout homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo2Q7TPD3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.31■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Robo2Q7TPD3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Robo2Q7TPD3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo2Q7TPD3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo2Q7TPD3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo2Q7TPD3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo2Q7TPD3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo2Q7TPD3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo2Q7TPD3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo2Q7TPD3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo2Q7TPD3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo2Q7TPD3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo2Q7TPD3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo2Q7TPD3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo2Q7TPD3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo2Q7TPD3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo2Q7TPD3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo2Q7TPD3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo2Q7TPD3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo2Q7TPD3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms