Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ubfd1Q78JW9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ubfd1Q78JW9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ubfd1Q78JW9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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