Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Higd1cQ76I25 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1cQ76I25 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms