Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncapd3Q6ZQK0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms