Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnot1Q6ZQ08 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms