Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms