Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc154Q6RUT8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms