Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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PdgfrlQ6PE55 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PdgfrlQ6PE55 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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PdgfrlQ6PE55 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PdgfrlQ6PE55 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PdgfrlQ6PE55 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PdgfrlQ6PE55 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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PdgfrlQ6PE55 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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PdgfrlQ6PE55 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PdgfrlQ6PE55 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 543.8 ms