Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrt3Q6PE13 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms