Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sarm1Q6PDS3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms