Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6PD19 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6PD19 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6PD19 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6PD19 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6PD19 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6PD19 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6PD19 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6PD19 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6PD19 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6PD19 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6PD19 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6PD19 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6PD19 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6PD19 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6PD19 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6PD19 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6PD19 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6PD19 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6PD19 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6PD19 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6PD19 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6PD19 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6PD19 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6PD19 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6PD19 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6PD19 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6PD19 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6PD19 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6PD19 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6PD19 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6PD19 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6PD19 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6PD19 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6PD19 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6PD19 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6PD19 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6PD19 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6PD19 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6PD19 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6PD19 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6PD19 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6PD19 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6PD19 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6PD19 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6PD19 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms