Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc148Q6P5U8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc148Q6P5U8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms