Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms