Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Slx4Q6P1D7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Slx4Q6P1D7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms