Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms