Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpbp1Q6NXH3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms