Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Krt77Q6IFZ6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Krt77Q6IFZ6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Krt77Q6IFZ6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt77Q6IFZ6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms