Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca2Q6DIC0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca2Q6DIC0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms