Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nop58Q6DFW4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms