Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6DFW0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6DFW0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6DFW0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms