Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms