Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Pdzrn3Q69ZS0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Pdzrn3Q69ZS0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzrn3Q69ZS0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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