Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msl2Q69ZF8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms