Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Pkp4Q68FH0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pkp4Q68FH0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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