Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sptbn2Q68FG2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms