Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg9aQ68FE2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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