Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CltcQ68FD5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CltcQ68FD5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms