Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Papd5Q68ED3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Papd5Q68ED3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms