Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4fQ66X05 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4fQ66X05 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4fQ66X05 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4fQ66X05 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4fQ66X05 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4fQ66X05 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4fQ66X05 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4fQ66X05 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4fQ66X05 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4fQ66X05 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4fQ66X05 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4fQ66X05 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4fQ66X05 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4fQ66X05 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4fQ66X05 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4fQ66X05 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4fQ66X05 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4fQ66X05 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4fQ66X05 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4fQ66X05 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4fQ66X05 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp4fQ66X05 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nlrp4fQ66X05 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp4fQ66X05 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms