Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Abcg1Q64343 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Abcg1Q64343 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Abcg1Q64343 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Abcg1Q64343 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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Abcg1Q64343 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Abcg1Q64343 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Abcg1Q64343 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Abcg1Q64343 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Abcg1Q64343 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Abcg1Q64343 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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