Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf1Q64213 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf1Q64213 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf1Q64213 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf1Q64213 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf1Q64213 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf1Q64213 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf1Q64213 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf1Q64213 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sf1Q64213 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sf1Q64213 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf1Q64213 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf1Q64213 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf1Q64213 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf1Q64213 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf1Q64213 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf1Q64213 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf1Q64213 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf1Q64213 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf1Q64213 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sf1Q64213 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf1Q64213 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf1Q64213 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf1Q64213 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf1Q64213 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf1Q64213 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf1Q64213 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sf1Q64213 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf1Q64213 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf1Q64213 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf1Q64213 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf1Q64213 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf1Q64213 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf1Q64213 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf1Q64213 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf1Q64213 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf1Q64213 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf1Q64213 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf1Q64213 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sf1Q64213 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf1Q64213 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf1Q64213 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf1Q64213 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf1Q64213 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sf1Q64213 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf1Q64213 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf1Q64213 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf1Q64213 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf1Q64213 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf1Q64213 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf1Q64213 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms