Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CochQ62507 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CochQ62507 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CochQ62507 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CochQ62507 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CochQ62507 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CochQ62507 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CochQ62507 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CochQ62507 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CochQ62507 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CochQ62507 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CochQ62507 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CochQ62507 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CochQ62507 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CochQ62507 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CochQ62507 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CochQ62507 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CochQ62507 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CochQ62507 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CochQ62507 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CochQ62507 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CochQ62507 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CochQ62507 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CochQ62507 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CochQ62507 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CochQ62507 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CochQ62507 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CochQ62507 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CochQ62507 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CochQ62507 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CochQ62507 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CochQ62507 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CochQ62507 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CochQ62507 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CochQ62507 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CochQ62507 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CochQ62507 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CochQ62507 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CochQ62507 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CochQ62507 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CochQ62507 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CochQ62507 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CochQ62507 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CochQ62507 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CochQ62507 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CochQ62507 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CochQ62507 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CochQ62507 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CochQ62507 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CochQ62507 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CochQ62507 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CochQ62507 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CochQ62507 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CochQ62507 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CochQ62507 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CochQ62507 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CochQ62507 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CochQ62507 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CochQ62507 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CochQ62507 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms