Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20865Q62460 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms