Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ss18Q62280 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ss18Q62280 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ss18Q62280 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ss18Q62280 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ss18Q62280 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ss18Q62280 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ss18Q62280 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ss18Q62280 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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