Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms