Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms