Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf3Q60980 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms