Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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Slc6a4Q60857 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a4Q60857 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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