Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim38Q5SZ99 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms