Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Bbs12Q5SUD9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Bbs12Q5SUD9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Bbs12Q5SUD9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Bbs12Q5SUD9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Bbs12Q5SUD9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Bbs12Q5SUD9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Bbs12Q5SUD9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Bbs12Q5SUD9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Bbs12Q5SUD9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Bbs12Q5SUD9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Bbs12Q5SUD9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Bbs12Q5SUD9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Bbs12Q5SUD9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Bbs12Q5SUD9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Bbs12Q5SUD9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Bbs12Q5SUD9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Bbs12Q5SUD9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Bbs12Q5SUD9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Bbs12Q5SUD9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Bbs12Q5SUD9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms