Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme4Q5SSW2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms