Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Utp18Q5SSI6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Utp18Q5SSI6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms